O Instituto Universitário Militar tem-se submetido a exercícios de avaliação externa de âmbito nacional. Neste contexto inclui-se a avaliação institucional e a avaliação e acreditação dos vários ciclos de estudos.

O Gabinete de Avaliação e Qualidade (GAQ) tem prosseguido os trabalhos tendentes a implementar uma política de avaliação e qualidade, de acordo com os padrões do Ensino Superior Universitário, supervisionados pela Agência de Avaliação e Acreditação do Ensino Superior (A3ES).

O GAQ do IUM, no âmbito do processo de implementação deste Instituto, tem vindo ainda a concentrar a atenção nos esforços de integração e alinhamento das ações desenvolvidas ao nível dos Gabinetes da Qualidade das diversas Unidades Orgânicas Autónomas (UOA): Escola Naval (EN); Academia Militar (AM) e Academia da Força Aérea (AFA).

No seguimento da consecução obtida nos processos que decorreram ao longo do ano letivo 2023/24, o IUM obteve a acreditação por um período de 6 anos, sem condições no âmbito da Avaliação Institucional, e a acreditação por 4 anos da Licenciatura em Tecnologias Militares Navais. Encontram-se atualmente em curso, 5 processos de acreditação.